STUDIUL COMPARATIV AL PARTICULARITĂȚILOR GENOMICE, IMUNOLOGICE ȘI FUNCȚIONALE ALE CARCINOAMELOR CU CELULE SCUAMOASE ÎN CINCI LOCALIZĂRI ANATOMICE

Autori

  • Valentina STRATAN Instituția Medico-Sanitară Publică Institutul Oncologic

DOI:

https://doi.org/10.52692/1857-0011.2021.3-71.05

Cuvinte cheie:

analiză comparativă, bioinformatică, biomarkeri, date omics, genetică moleculară, imunologie

Rezumat

Carcinoamele cu celule scuamoase (CCS) sunt cele mai frecvente tumori solide umane și o cauză majoră a mortalității prin cancer. Acestea prezintă un grup de neoplazii agresive, complexe din punct de vedere genetic și cu un risc mare derecurență și metastazare. Diagnosticul precoce, eficientizarea managementului bolii și adaptarea terapiilor sunt cerințe actuale și necesare pentru reducerea mortalității. Schimbările genetice, alterarea căilor de semnalizare intracelulară precumși răspunsul sistemului imun în aceste cancere pot fi influențate de diverși factori precum: virusurile oncogene (HPV-ul),microbiomul local, localizarea tumorii, etc. Pentru a extinde înțelegerea și aria cunoștințelor despre aceste malignități,a pune în evidență similaritățile și diferențele biologice între anumite tipuri de CCS, sunt absolut necesare cercetăricomplexe, comparative ale evenimentelor genomice, epigenomice, proteomice, metabolomice (Pan-Cancer Analysis), amodificărilor microbiomului, imunității și a impactului virusurilor oncogene. Această abordare complexă în plan comparativ nu a fost atinsă pe larg de studiile anterioare și va permite identificarea similarităților și deosebirilor dintre aspectelemulti-omics și non-omics, determinarea biomarkerilor individuali și comuni în 5 tipuri de carcinoame scuamoase: piele,cap-gât, esofag, pulmonar și cervical.

Biografie autor

Valentina STRATAN, Instituția Medico-Sanitară Publică Institutul Oncologic

dr. șt. biol., conf. cerc., conducător proiect

Referințe

Bailiang Li, Yi Cui et al., The Immune Subtypes and Landscape of Squamous Cell Carcinoma, Clin Cancer Res, 2019 Jun 15;25(12):3528-3537, doi: 10.1158/1078-0432.CCR-18-4085;

Daniele Ramazzotti, Avantika Lal, Bo Wang, Serafim Batzoglou & Arend Sidow, Multi-omic tumor data reveal diversity of molecular mechanisms that correlate with survival, Nature Communications volume 9, 4453, 26 October 2018, DOI: https://doi.org/10.1038/s41467-018-06921-8;

Francisco Azuaje, Artificial intelligence for precision oncology: beyond patient stratification, npj Precision Oncology volume 3, Article number: 6, 25 February 2019, DOI: https://doi.org/10.1038/s41698-019-0078-1;

Francisco Sanchez - Vega et al., Oncogenic Signaling Pathways in The Cancer Genome Atlas, Cell, Volume 173, ISSUE 2, April 05, 2018, P321-337.e10, DOI: https://doi.org/10.1016/j.cell.2018.03.035;

Freddie Bray, BSc, MSc, PhD et al., Global cancer statistics 2018: GLOBOCAN estimates of incidence and mortality worldwide for 36 cancers in 185 countries, CA CANCER J CLIN 2018 Nov;68(6):394-424, doi: 10.3322/caac.21492;

Jianfang Liu et al., An Integrated TCGA Pan-Cancer Clinical Data Resource to Drive High-Quality Survival Outcome Analytics, Cell, Volume 173, ISSUE 2, April 05, 2018, P400-416.e11, DOI: https://doi.org/10.1016/j.cell.2018.02.052;

Matthew H. Bailey et al., Comprehensive Characterization of Cancer Driver Genes and Mutations, CELL, Volume 173, ISSUE 2, April 05, 2018, P371-385.e18, DOI: https://doi.org/10.1016/j.cell.2018.02.060;

Nezar N. Al-Hebshi, Wenche S. Borgnakke, Newell W. Johnson, The Microbiome of Oral Squamous Cell Carcinomas: a Functional Perspective, Springer International Publishing, 18 April 2019, DOI: https://doi.org/10.1007/s40496-019-0215-5;

Otília Menyhárt and Balázs Győrffy, Multi-omics approaches in cancer research with applications in tumor subtyping, prognosis, and diagnosis, Computational and Structural Biotechnology Journal, Volume 19, 2021, Pages 949-960, doi: https://doi.org/10.1016/j.csbj.2021.01.009;

Sajib Chakraborty, Md. Ismail Hosen, Musaddeque Ahmed, and Hossain Uddin Shekhar, Onco-Multi-OMICS Approach: A New Frontier in Cancer Research, BioMed Research International, 3 October 2018, doi: 10.1155/2018/9836256;

Serghei Mangul et al., How bioinformatics and open data can boost basic science in countries and universities with limited resources, Nature Biotechnology, VOL 37, MARCH 2019, 324–326, DOI: https://doi.org/10.1038/s41587-019-0053-y;

Shankargouda Patil et al., Cancer oriented biobanks: A comprehensive review, Oncol Rev. 2018 Jan 30; 12(1): 357., DOI: 10.4081/oncol.2018.357;

Singer J et al., Bioinformatics for precision oncology, Brief Bioinform. 2019 May 21;20(3):778-788, DOI: 10.1093/bib/bbx143

Vésteinn Thorsson et al., The Immune Landscape of Cancer, Cell, Volume 48, ISSUE 4, April 17, 2018, P812-830.e14, DOI: https://doi.org/10.1016/j.immuni.2018.03.023;

Yingxia Zheng et al., Immune suppressive landscape inthe human esophageal squamous cell carcinoma microenvironment, Nature Communications, Article number: 6268, 08 December 2020, doi: https://doi.org/10.1038/s41467-020-20019-0.

Descărcări

Publicat

2021-11-17

Număr

Secțiune

Articol de cercetare