Сравнителъное исследование геномных, иммунологических и функционалъных особенностей плоскоклеточного карцинома в пяти анатомических локализациях.
DOI:
https://doi.org/10.52692/1857-0011.2021.3-71.05Ключевые слова:
сравнительный анализ, биоинформатика, биомаркеры, омиксные данные, молекулярная генетика, иммунологияАннотация
Плоскоклеточная карцинома (ПК) является наиболее распространенной солидной опухолью человека и однаиз основных причинах смертности от рака. Они представляют группу агрессивных, генетически комплексныхновообразований с высоким риском рецидива и метастазирования. В Республике Молдова в 2018 году, заболеваемость раком головы-шеи, пищевода, легких, кожи и шейки матки составила 3242 случая, из которых около 50%представляли собой гистопатологическую форму плоскоклеточного карцинома. Ранняя диагностика, эффективность управления болезнью и обеспечение эфективности методов лечения являются актуальными и необходимыми требованиями для снижения смертности. Генетические изменения, изменение внутриклеточных сигнальныхпутей и ответ иммунной системы при этих раках могут зависеть от различных факторов, таких как: онкогенныевирусы (ВПЧ), локальный микробиом, локализация опухоли и т.д. Чтобы расширить понимание и область знаний об этих злокачественных новообразованиях, выделить биологические сходства и различия между определенными типами ПК, необходимо провести комплексное сравнительное исследование геномных, эпигеномных протеомных, метаболических и микробиомных событий связанные с этими видами рака. Этот комплексный сравнительный подход не был широко рассмотрен в предыдущих мировых исследованиях и позволит выявить сходства и различия между аспектами multi-omics и non-omics, определить индивидуальные и общие биомаркеры в 5типах плоскоклеточного карцинома: кожа, голова-шея, пищевода, легких и шейки матки. Целью проекта являетсясравнительное исследование ПК с различных анатомических локализациях для оптимизации скрининга, раннейдиагностики и стратегий лечения этих типов рака.
Библиографические ссылки
Bailiang Li, Yi Cui et al., The Immune Subtypes and Landscape of Squamous Cell Carcinoma, Clin Cancer Res, 2019 Jun 15;25(12):3528-3537, doi: 10.1158/1078-0432.CCR-18-4085;
Daniele Ramazzotti, Avantika Lal, Bo Wang, Serafim Batzoglou & Arend Sidow, Multi-omic tumor data reveal diversity of molecular mechanisms that correlate with survival, Nature Communications volume 9, 4453, 26 October 2018, DOI: https://doi.org/10.1038/s41467-018-06921-8;
Francisco Azuaje, Artificial intelligence for precision oncology: beyond patient stratification, npj Precision Oncology volume 3, Article number: 6, 25 February 2019, DOI: https://doi.org/10.1038/s41698-019-0078-1;
Francisco Sanchez - Vega et al., Oncogenic Signaling Pathways in The Cancer Genome Atlas, Cell, Volume 173, ISSUE 2, April 05, 2018, P321-337.e10, DOI: https://doi.org/10.1016/j.cell.2018.03.035;
Freddie Bray, BSc, MSc, PhD et al., Global cancer statistics 2018: GLOBOCAN estimates of incidence and mortality worldwide for 36 cancers in 185 countries, CA CANCER J CLIN 2018 Nov;68(6):394-424, doi: 10.3322/caac.21492;
Jianfang Liu et al., An Integrated TCGA Pan-Cancer Clinical Data Resource to Drive High-Quality Survival Outcome Analytics, Cell, Volume 173, ISSUE 2, April 05, 2018, P400-416.e11, DOI: https://doi.org/10.1016/j.cell.2018.02.052;
Matthew H. Bailey et al., Comprehensive Characterization of Cancer Driver Genes and Mutations, CELL, Volume 173, ISSUE 2, April 05, 2018, P371-385.e18, DOI: https://doi.org/10.1016/j.cell.2018.02.060;
Nezar N. Al-Hebshi, Wenche S. Borgnakke, Newell W. Johnson, The Microbiome of Oral Squamous Cell Carcinomas: a Functional Perspective, Springer International Publishing, 18 April 2019, DOI: https://doi.org/10.1007/s40496-019-0215-5;
Otília Menyhárt and Balázs Győrffy, Multi-omics approaches in cancer research with applications in tumor subtyping, prognosis, and diagnosis, Computational and Structural Biotechnology Journal, Volume 19, 2021, Pages 949-960, doi: https://doi.org/10.1016/j.csbj.2021.01.009;
Sajib Chakraborty, Md. Ismail Hosen, Musaddeque Ahmed, and Hossain Uddin Shekhar, Onco-Multi-OMICS Approach: A New Frontier in Cancer Research, BioMed Research International, 3 October 2018, doi: 10.1155/2018/9836256;
Serghei Mangul et al., How bioinformatics and open data can boost basic science in countries and universities with limited resources, Nature Biotechnology, VOL 37, MARCH 2019, 324–326, DOI: https://doi.org/10.1038/s41587-019-0053-y;
Shankargouda Patil et al., Cancer oriented biobanks: A comprehensive review, Oncol Rev. 2018 Jan 30; 12(1): 357., DOI: 10.4081/oncol.2018.357;
Singer J et al., Bioinformatics for precision oncology, Brief Bioinform. 2019 May 21;20(3):778-788, DOI: 10.1093/bib/bbx143
Vésteinn Thorsson et al., The Immune Landscape of Cancer, Cell, Volume 48, ISSUE 4, April 17, 2018, P812-830.e14, DOI: https://doi.org/10.1016/j.immuni.2018.03.023;
Yingxia Zheng et al., Immune suppressive landscape inthe human esophageal squamous cell carcinoma microenvironment, Nature Communications, Article number: 6268, 08 December 2020, doi: https://doi.org/10.1038/s41467-020-20019-0.
Загрузки
Опубликован
Выпуск
Раздел
Лицензия
Copyright (c) 2022 Вестник Академии Наук Молдовы. Медицина
Это произведение доступно по лицензии Creative Commons «Attribution» («Атрибуция») 4.0 Всемирная.
